한글자막과 영문자막 두 개의 자막이 있다는 말씀이면...

두 개의 자막을 통합해야 됩니다.

우선 영문자막을 워드패드나 메모장에서 열어서 BODY 다음부터 /BODY 바로 전까지를 복사하세요.
그리고 한글자막을 열어서 /BODY 바로 앞에 붙여넣으세요.

그리고 .KRCC {Name:Korean; lang:ko-KR; SAMIType:CC;} 다음 줄에
영문자막의 Class에 맞게
.ENCC {Name:English; lang:eg-US; SAMIType:CC;} 또는
.EGCC {Name:English; lang:eg-US; SAMIType:CC;} 를 넣어주면 됩니다.