제가 확인해 본 바로는  4.2 버젼에서 4.1 파일이 아무 이상없이 실행 됩니다.
아마 뭔가 잘못 하신것 같네요..
사용하셨다는 에디터가 ASMenuEd.exe 가 아니셨는지 ??
새롭게 오토런을 만들때는 ASWizard.exe를 사용 하시면 되고(마법사 아시죠!)
기존에 만들어져 있는 오토런을 수정 하실때는 ASMenuEd.exe 를 사용 하심 됩니다.

그리고 등록 메시지에 관한 내용은 제가 FAQ에 넣어둔 부분인데 읽어 보시지 않으셨나 보네요.
답변은 그곳에서 얻으실 수 있을 겁니다.
친구분이 첨에 안되는 경우는 아마 없을 겁니다.
한 PC에서 일정 횟수 이상 사용 해야만 등록 메시지가 뜨는 것으로 알고있습니다.